Les micro-pores fins sont si petits qu'ils empêchent les micro-particules fines, comme les bactéries, les virus et même les particules de colorants alimentaires, de passer par le chemin tortueux que peut traverser l'eau. Ces contaminants sont piégés dans les micro-pores fins, tandis que les molécules H2O, bien plus petites, ne le sont pas. Cette méthode sépare les contaminants de l'eau purifiée. La formule brevetée utilisée dans la composition des filtres Black Berkey permet de compenser la taille extrêmement petite des pores en multipliant le nombre de micropores par cm². C’est la raison pour laquelle les filtres Black Berkey permettent de filtrer environ 8 fois plus d’eau par heure que les autres filtres. Alors que les impuretés peuvent boucher les pores situés à la surface du filtre, il est peu probable qu’elles puissent boucher les pores qui se trouvent plus en profondeur et obstruer ainsi le filtre. La majorité des pores situés à la surface du filtre vont éventuellement se boucher, ce qui ralentira le débit d’eau. Pour les déboucher, il suffit de brosser la surface du filtre avec un tampon à récurer ou une brosse à dents. Par conséquent, même si les filtres Black Berkey ont des pores extrêmement petits, ils ne risquent pas de s’obstruer prématurément.